143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4930 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
410 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
410 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
410 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  45.55 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 
408 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 
457 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 
400 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 
421 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  28.54 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 
435 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 
413 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  29.43 
 
 
396 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 
440 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
406 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 
419 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  23.33 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.64 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  19.8 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 
577 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 
577 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 
577 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 
577 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 
577 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 
432 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.31 
 
 
486 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
423 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.68 
 
 
483 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.59 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.07 
 
 
577 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  22.73 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.92 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
530 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 
582 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24 
 
 
445 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
572 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 
605 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.75 
 
 
580 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.25 
 
 
573 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28 
 
 
500 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.22 
 
 
485 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 
421 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 
597 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  22 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  24.71 
 
 
918 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.25 
 
 
598 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  24.58 
 
 
580 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  25.85 
 
 
607 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  25.66 
 
 
575 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  25.66 
 
 
575 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  26.46 
 
 
580 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
578 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.74 
 
 
626 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  24.88 
 
 
497 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
578 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
578 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
578 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  23.65 
 
 
449 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.57 
 
 
581 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  25.72 
 
 
498 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 
578 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
578 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  25.35 
 
 
578 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 
573 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 
578 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 
578 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
588 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  25.18 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.27 
 
 
509 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  28.48 
 
 
581 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.97 
 
 
581 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  25.18 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 
487 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.05 
 
 
578 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  23.77 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 
574 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
434 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  25.06 
 
 
580 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.02 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  24.69 
 
 
580 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.12 
 
 
596 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 
492 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  24.94 
 
 
580 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 
623 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>