64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4701 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 408 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  41.98 
 
 		 403 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  41.77 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  30.08 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  28.16 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  22.14 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.94 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.35 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  28.95 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.36 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 460 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.66 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  24.85 
 
 		 918 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  31.3 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 491 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 667 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  22.81 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 623 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  23.99 
 
 		 626 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  20.8 
 
 		 527 aa  46.6  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  21.05 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  30.3 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.75 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  27.56 
 
 		 566 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 		 566 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>