138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1844 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 410 aa  807    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  47.22 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  42.57 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  44.99 
 
 		 421 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  41.97 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  49.49 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  45.96 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  42.36 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  51.66 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  39.36 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.28 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.15 
 
 		 464 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.06 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  32.19 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.19 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.19 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  29.3 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  29.89 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 460 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.77 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  23.37 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  27.67 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.56 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 		 610 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  22.76 
 
 		 834 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.33 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25.09 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.79 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.09 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  22.78 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.47 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.02 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  28.92 
 
 		 918 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  22.77 
 
 		 1050 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  24.12 
 
 		 572 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.96 
 
 		 626 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.01 
 
 		 605 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  26.74 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  22.57 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.12 
 
 		 598 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.46 
 
 		 597 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.28 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  26.67 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  25.56 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  22.54 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  25.47 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4227  sodium/hydrogen exchanger  25.72 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>