More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3326 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 413 aa  818    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  38.99 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  39.15 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  37.95 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  39.3 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  34.84 
 
 		 173 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 441 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.86 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.53 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26 
 
 		 626 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  26.49 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  25.72 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.22 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  28.02 
 
 		 616 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.21 
 
 		 597 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  29.33 
 
 		 624 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.89 
 
 		 448 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  30.25 
 
 		 624 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  28.25 
 
 		 485 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 598 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.06 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  25.47 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.71 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.87 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.99 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 496 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  26.44 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  24.77 
 
 		 834 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.92 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.51 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.94 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 623 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  24.84 
 
 		 576 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.59 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  29.69 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  28.01 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.67 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>