173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6115 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 424 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  57.35 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  55.88 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  50.12 
 
 		 410 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  48.01 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  50.24 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  49.27 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  44.52 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  47.03 
 
 		 423 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  47 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  41.53 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  42.2 
 
 		 415 aa  278  9e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  42.44 
 
 		 415 aa  276  5e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  46.92 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  36.79 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  38.12 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.7 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.55 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  35.95 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  33.83 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  33.91 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 		 441 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  33.5 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.39 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.33 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.53 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  24.8 
 
 		 918 aa  70.1  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  28.94 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  30.35 
 
 		 616 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  24.27 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  25.38 
 
 		 834 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  37.36 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.93 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 		 598 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.55 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 572 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  29.23 
 
 		 582 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  35.78 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  30.64 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  30 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  29.09 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.81 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.17 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.74 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.46 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.64 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  24.4 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.44 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  28.49 
 
 		 572 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.44 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  28.39 
 
 		 624 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.43 
 
 		 596 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.98 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  29.72 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  28.39 
 
 		 624 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  27.25 
 
 		 497 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>