34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3078 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 173 aa  337  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  77.42 
 
 		 436 aa  225  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  42.58 
 
 		 430 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  41.33 
 
 		 421 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  38.22 
 
 		 406 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  43.15 
 
 		 435 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 		 400 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 		 413 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  38.31 
 
 		 396 aa  84.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 		 460 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  38.46 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 400 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  71.43 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 423 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 		 420 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 410 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 410 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 410 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  21.74 
 
 		 403 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 432 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  38.3 
 
 		 393 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 413 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 442 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 429 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 443 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  33.61 
 
 		 449 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 429 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  28.48 
 
 		 419 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.54 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 		 415 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>