257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3316 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
420 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  62.38 
 
 
432 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  58.88 
 
 
413 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  41.06 
 
 
448 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 
443 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  37.9 
 
 
449 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 
445 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
442 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 
453 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.24 
 
 
449 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.06 
 
 
448 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 
424 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  39.42 
 
 
421 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.05 
 
 
451 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  37.74 
 
 
424 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  35.93 
 
 
429 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  36.96 
 
 
419 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.47 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  35.27 
 
 
429 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 
444 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 
441 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 
441 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  37.25 
 
 
434 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 
437 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  34.88 
 
 
454 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  34.44 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  40.34 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
440 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 
423 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 
413 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 
413 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  39.71 
 
 
423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.12 
 
 
439 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.12 
 
 
439 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  36.12 
 
 
439 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
439 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
410 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.44 
 
 
464 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 
425 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
413 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
400 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 
440 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 
421 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.89 
 
 
436 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
415 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
410 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.79 
 
 
498 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.39 
 
 
486 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.16 
 
 
483 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 
393 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
435 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 
608 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  28.13 
 
 
396 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.94 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25.54 
 
 
481 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.23 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 
403 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.76 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  29.83 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.9 
 
 
626 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  24.23 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.85 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  24.64 
 
 
918 aa  69.7  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.81 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.47 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  23.02 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.79 
 
 
610 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
572 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.74 
 
 
597 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.5 
 
 
597 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24 
 
 
477 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  24.26 
 
 
597 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  22.79 
 
 
605 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 
498 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 
598 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  26.98 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.246697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>