171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1700 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  90.91 
 
 		 429 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  92.25 
 
 		 413 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  92.25 
 
 		 413 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 429 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  53.83 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  53.36 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  52.26 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  53.7 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  52.31 
 
 		 441 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  52.31 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  53.7 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  53.7 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  55.56 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  55.56 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  55.56 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  53.01 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.64 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  43.85 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  45.56 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.42 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  44.06 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 		 442 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  36.67 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.46 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.76 
 
 		 448 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  36 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  32.96 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.39 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.02 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 424 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.01 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.13 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.08 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.68 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.73 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  22.73 
 
 		 527 aa  67  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 		 483 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.32 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.88 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.34 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  24.23 
 
 		 608 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26.93 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.27 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.17 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  25.57 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  25.53 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.02 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.06 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.44 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  25.64 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.08 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.44 
 
 		 616 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 573 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 		 545 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  24.75 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  28.25 
 
 		 834 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.12 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 		 605 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>