182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1397 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 442 aa  872    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  47.64 
 
 		 449 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  47.43 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  47.42 
 
 		 448 aa  315  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  47.32 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 		 429 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 		 413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  39.1 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.37 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  40.09 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 420 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  38.95 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  38.95 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  39.1 
 
 		 454 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.23 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 432 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  35.07 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.52 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  37 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.03 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  35.67 
 
 		 439 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  29.77 
 
 		 597 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  25.23 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.42 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  29 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.17 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  24.94 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.11 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  21.74 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.14 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.54 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.37 
 
 		 918 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  26.61 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.03 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 572 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  23.84 
 
 		 509 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  27.54 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.06 
 
 		 597 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  25.97 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 588 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  25.69 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.78 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  25.81 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.26 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  24.88 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.49 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  24.94 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.37 
 
 		 834 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.76 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.94 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  19.81 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>