More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0398 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 415 aa  793    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  72.12 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  69.05 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  69.05 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  69.62 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  64.36 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 400 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  31.5 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  32.21 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  30.51 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.75 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  29.11 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 608 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 573 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.75 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.75 
 
 		 580 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  29.08 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  31.06 
 
 		 616 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.8 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.59 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.76 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.92 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.82 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  28.61 
 
 		 486 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  26.37 
 
 		 577 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.16 
 
 		 509 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 570 aa  99.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  29.31 
 
 		 580 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.36 
 
 		 498 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 574 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  28.01 
 
 		 580 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  28.02 
 
 		 575 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.37 
 
 		 576 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  28.02 
 
 		 575 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.94 
 
 		 580 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 597 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.6 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.57 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  29.12 
 
 		 505 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  27.72 
 
 		 499 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 577 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 577 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 577 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 577 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 577 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  28.61 
 
 		 610 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  28.43 
 
 		 580 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  28.43 
 
 		 580 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.76 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.58 
 
 		 597 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 588 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 442 aa  89.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0086  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 505 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  29.58 
 
 		 572 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.54 
 
 		 596 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 		 490 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 		 598 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 		 498 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.54 
 
 		 597 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.34 
 
 		 464 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>