124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6484 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
440 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  89.32 
 
 
441 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
440 aa  853    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  86.73 
 
 
439 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  99.32 
 
 
440 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  89.32 
 
 
441 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  72.21 
 
 
439 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  72.21 
 
 
439 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  65.12 
 
 
441 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  72.21 
 
 
439 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  68.34 
 
 
451 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  64.19 
 
 
444 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  54.63 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  53.94 
 
 
429 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  54.2 
 
 
413 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  54.2 
 
 
413 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  47.05 
 
 
464 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  43.67 
 
 
449 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.32 
 
 
443 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  47.66 
 
 
445 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  43.31 
 
 
448 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  37.64 
 
 
442 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 
453 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  37.05 
 
 
420 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  38.93 
 
 
454 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  38.49 
 
 
454 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.97 
 
 
448 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.72 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 
432 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
413 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
424 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
419 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.92 
 
 
415 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
415 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
425 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
437 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
423 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
421 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 
424 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 
424 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
413 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 
413 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
410 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
421 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  31.24 
 
 
425 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  28.2 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.96 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  29.27 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  29.79 
 
 
597 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.6 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.31 
 
 
597 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
608 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  24.29 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  28.5 
 
 
597 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
588 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
491 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.79 
 
 
597 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.94 
 
 
592 aa  57.4  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
605 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.86 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
741 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
546 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  26.67 
 
 
834 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  26.97 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 
547 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.3 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
574 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 
500 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.06 
 
 
918 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 
393 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.25 
 
 
572 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  40.96 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
487 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  24.54 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  33.55 
 
 
542 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.72 
 
 
1050 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 
410 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.88 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3251  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 
503 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  21.58 
 
 
498 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
617 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  23.83 
 
 
497 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
530 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 
596 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 
535 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.02 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>