79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01890 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  100 
 
 
918 aa  1876    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  47.37 
 
 
1050 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  40.26 
 
 
834 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  39.22 
 
 
605 aa  316  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  32.78 
 
 
698 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  37.76 
 
 
480 aa  259  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
410 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01920  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  30.4 
 
 
532 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.017465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
410 aa  114  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 
408 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
413 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  28.96 
 
 
436 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 
424 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
415 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 
442 aa  70.1  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
437 aa  67  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 
419 aa  65.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 
403 aa  65.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.81 
 
 
448 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  23.33 
 
 
421 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
443 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
434 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  24.31 
 
 
449 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
423 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
400 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 
460 aa  61.6  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.85 
 
 
415 aa  60.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 
408 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.65 
 
 
449 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 
423 aa  59.7  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 
415 aa  59.7  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 
420 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
413 aa  58.9  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  25.82 
 
 
396 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
412 aa  57.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
440 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  26.34 
 
 
581 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  23.15 
 
 
431 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 
393 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  33.61 
 
 
408 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  26.7 
 
 
553 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  26.9 
 
 
454 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 
448 aa  54.3  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.61 
 
 
464 aa  54.3  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 
445 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 
568 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.77 
 
 
578 aa  52  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
429 aa  51.2  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
425 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
429 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
410 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.63 
 
 
698 aa  50.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  21.07 
 
 
532 aa  48.5  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
562 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  21.07 
 
 
532 aa  48.5  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 
564 aa  48.5  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  21.61 
 
 
760 aa  48.1  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  22.25 
 
 
445 aa  48.1  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
424 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 
741 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
430 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  24.79 
 
 
486 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  23.2 
 
 
487 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  24.06 
 
 
616 aa  46.2  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
444 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  25.5 
 
 
534 aa  45.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  26.28 
 
 
571 aa  44.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  22.81 
 
 
531 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  25.64 
 
 
500 aa  44.3  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>