More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1837 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  93.61 
 
 		 460 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 412 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  69.92 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  67.02 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  67.69 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  64.96 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  30.64 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  34.13 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.75 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.75 
 
 		 598 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.63 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.37 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 608 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.89 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.8 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 581 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  21.83 
 
 		 612 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  28.39 
 
 		 597 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 572 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.72 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 496 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 573 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 580 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.69 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 487 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  27.13 
 
 		 574 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 574 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  29.33 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.49 
 
 		 581 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 509 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.57 
 
 		 616 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 		 580 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 		 580 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 576 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 576 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 576 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 		 576 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  27.23 
 
 		 575 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  27.23 
 
 		 575 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  30.03 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  27.13 
 
 		 574 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 527 aa  86.3  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  26.89 
 
 		 580 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.71 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.59 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.49 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  26.63 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.5 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  35.81 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  23.96 
 
 		 606 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.78 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  26.87 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  26.87 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.26 
 
 		 576 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.99 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.45 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.75 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  30.27 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  27.9 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000394197  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.53 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.37 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>