157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0416 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
406 aa  787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  65.1 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  42.05 
 
 
436 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  40.51 
 
 
421 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  42.41 
 
 
435 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  39.03 
 
 
440 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 
413 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  37.22 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  37.6 
 
 
396 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  40.82 
 
 
393 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
403 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
415 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
410 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
410 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
410 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 
400 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
408 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  38.22 
 
 
173 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.19 
 
 
597 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.38 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.03 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25.6 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.6 
 
 
918 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 
448 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.39 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.92 
 
 
597 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.77 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
574 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.4 
 
 
596 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.19 
 
 
478 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
588 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.71 
 
 
597 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.68 
 
 
445 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
442 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  29.39 
 
 
500 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  25.63 
 
 
598 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 
605 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 
418 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.66 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  25.43 
 
 
535 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  30.3 
 
 
498 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
530 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  24.85 
 
 
480 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  29.31 
 
 
498 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
573 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 
608 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 
623 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
491 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0329  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.21 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.46 
 
 
464 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.56 
 
 
597 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
420 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.93 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
692 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
692 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
445 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 
483 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
490 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
598 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
492 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  25.14 
 
 
509 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 
526 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  26.97 
 
 
592 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.25 
 
 
616 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.84 
 
 
485 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
667 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  24.32 
 
 
576 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>