More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6040 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 417 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  80.43 
 
 		 420 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  64.16 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  56.49 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  55.29 
 
 		 418 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  54.37 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  45 
 
 		 427 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  42.06 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  43.55 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  44.77 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  41.45 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  40.63 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  42.96 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  41.5 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  38.54 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  42.89 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  40.34 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  40.96 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  37.14 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  42.34 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  42.09 
 
 		 411 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  41.71 
 
 		 411 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  38.39 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  41.06 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  39.23 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  41.06 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  35.53 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  37.47 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  35.02 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  35.63 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  38.89 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  36.99 
 
 		 417 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  41.61 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  38.34 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  38.63 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  38.04 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  38.48 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 434 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.78 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  33.43 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 531 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 533 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 533 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 520 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32.5 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 		 527 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  30.71 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 		 682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.33 
 
 		 534 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.58 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30.33 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.68 
 
 		 528 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 517 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.79 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  28.43 
 
 		 538 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 536 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 526 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.56 
 
 		 526 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 538 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 538 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 535 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 526 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 517 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 		 812 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.48 
 
 		 537 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.95 
 
 		 527 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>