More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2041 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
520 aa  1020    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  63.53 
 
 
521 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  61.82 
 
 
527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  55.4 
 
 
531 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  35.82 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  35.82 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  38.93 
 
 
397 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 
397 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  35.87 
 
 
517 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  37.36 
 
 
538 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  37.36 
 
 
538 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  33.74 
 
 
547 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 
517 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 
517 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 
533 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  33.42 
 
 
682 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 
705 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
537 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.44 
 
 
528 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 
425 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 
680 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 
537 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 
526 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 
832 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 
534 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 
531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  35.82 
 
 
419 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 
534 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  36.29 
 
 
419 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.31 
 
 
435 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 
524 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
519 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  29.95 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
832 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 
832 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  29.86 
 
 
537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
526 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30.92 
 
 
531 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.24 
 
 
424 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  35.07 
 
 
399 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 
524 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  36.39 
 
 
424 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.35 
 
 
532 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.15 
 
 
528 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
427 aa  144  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  36.1 
 
 
424 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
513 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 
527 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.16 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  32.08 
 
 
624 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 
421 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
526 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
417 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
526 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 
526 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
526 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  31 
 
 
531 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  32.35 
 
 
427 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  29.41 
 
 
1247 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  32.06 
 
 
417 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  32.06 
 
 
444 aa  136  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  37.05 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 
533 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  29.46 
 
 
535 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  28.71 
 
 
553 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 
413 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 
420 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  33.62 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
423 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  34.68 
 
 
422 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  33.53 
 
 
437 aa  133  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  26.31 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 
418 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.26 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  36.33 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.19 
 
 
526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  26.52 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  31.98 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 
521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  34.35 
 
 
423 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>