More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0629 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  81.28 
 
 		 424 aa  687    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  80.76 
 
 		 424 aa  683    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 427 aa  825    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  51.46 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  51.94 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  53.4 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  53.16 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  51.36 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  49.26 
 
 		 411 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  49.26 
 
 		 411 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  49.26 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  52.31 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  49.02 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  50.6 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  46.06 
 
 		 418 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  49.64 
 
 		 422 aa  346  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  48.67 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  45.37 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  46.7 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  43.92 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  43.96 
 
 		 418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  42.96 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  44.28 
 
 		 420 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  42.96 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  38.07 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  40.98 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  41.49 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  44.37 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  40.53 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.34 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  39.62 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  39.35 
 
 		 417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  43.24 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  40.66 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  42.75 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  40.87 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  41.05 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.34 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  40.66 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  40.66 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  40.38 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  40.06 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 		 531 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  33.05 
 
 		 533 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  33.05 
 
 		 533 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 		 521 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32.06 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.47 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  28.92 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 526 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  30.57 
 
 		 812 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  26.2 
 
 		 533 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 517 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 682 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  25.88 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  30.08 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 705 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 534 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  25.35 
 
 		 531 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 		 547 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 680 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  27.69 
 
 		 538 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  30.46 
 
 		 531 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  29.14 
 
 		 553 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  25.76 
 
 		 524 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  28.48 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  28.31 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.45 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 526 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 703 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 703 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.48 
 
 		 525 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 521 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>