More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4062 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
533 aa  1071    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  42.18 
 
 
531 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  44.15 
 
 
533 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  39.42 
 
 
534 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  39.11 
 
 
537 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  40.6 
 
 
537 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  39.42 
 
 
533 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 
524 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  38.76 
 
 
537 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  38.61 
 
 
525 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  43.94 
 
 
425 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  38.84 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  38.4 
 
 
531 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  35.19 
 
 
535 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 
535 aa  312  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 
550 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 
527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  38.81 
 
 
527 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  37.48 
 
 
524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  44.29 
 
 
423 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  35.27 
 
 
537 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 
539 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  36.64 
 
 
550 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 
534 aa  289  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  33.77 
 
 
524 aa  286  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  37.67 
 
 
524 aa  286  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.57 
 
 
533 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 
526 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  35.86 
 
 
526 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 
536 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.24 
 
 
528 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
532 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
532 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.58 
 
 
531 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  36.14 
 
 
526 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 
526 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 
526 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  33.78 
 
 
624 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  35.27 
 
 
526 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.45 
 
 
538 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32 
 
 
526 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.08 
 
 
621 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  34.49 
 
 
533 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  34.49 
 
 
533 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.2 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 
624 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 
533 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 
624 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 
531 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 
527 aa  240  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.12 
 
 
526 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
488 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.24 
 
 
551 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 
551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 
526 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  30.93 
 
 
526 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  37.03 
 
 
535 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 
527 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30.13 
 
 
527 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 
552 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 
555 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 
527 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 
527 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  36.82 
 
 
535 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  36.82 
 
 
535 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  30.35 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 
527 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 
525 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
564 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
527 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 
623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
555 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  30.16 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
555 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 
554 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
555 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
555 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
633 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.01 
 
 
566 aa  216  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 
527 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
566 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 
631 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 
511 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  29.94 
 
 
654 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 
530 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.63 
 
 
581 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 
525 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 
525 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 
549 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.24 
 
 
553 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 
521 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  30.64 
 
 
523 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>