More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4534 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  92.97 
 
 
526 aa  888    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
526 aa  1028    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  91.06 
 
 
526 aa  906    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  93.35 
 
 
526 aa  893    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  92.97 
 
 
526 aa  884    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  93.73 
 
 
526 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  93.35 
 
 
526 aa  893    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  63.92 
 
 
528 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  49.53 
 
 
534 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  42.86 
 
 
526 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
526 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  43.16 
 
 
528 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  43.29 
 
 
527 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  43.1 
 
 
527 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  42.96 
 
 
538 aa  350  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 
526 aa  350  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  41.97 
 
 
527 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  41.14 
 
 
527 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  42.42 
 
 
527 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  42.23 
 
 
527 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  42.23 
 
 
527 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  41.92 
 
 
531 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  42.94 
 
 
531 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  39.69 
 
 
526 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  40.3 
 
 
526 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  38.14 
 
 
524 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  35.22 
 
 
533 aa  277  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 
531 aa  269  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 
534 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 
533 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 
537 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  32.44 
 
 
537 aa  246  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  34.1 
 
 
537 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 
525 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  37.36 
 
 
553 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.26 
 
 
531 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  34.35 
 
 
537 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 
550 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  35.96 
 
 
535 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 
521 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  36.89 
 
 
550 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
511 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 
524 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
533 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 
524 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.83 
 
 
535 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 
532 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 
532 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.66 
 
 
533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  36.96 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.6 
 
 
536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  37.29 
 
 
556 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  31.39 
 
 
527 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 
521 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  32.36 
 
 
624 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 
624 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.19 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 
527 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.39 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 
525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 
519 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  36.54 
 
 
533 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  36.54 
 
 
533 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.65 
 
 
533 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  38.65 
 
 
527 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.62 
 
 
524 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 
552 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 
425 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 
624 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 
525 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  35.57 
 
 
488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  35.56 
 
 
525 aa  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 
527 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 
549 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 
551 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
621 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.83 
 
 
551 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 
513 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 
514 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 
555 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 
555 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 
633 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 
545 aa  176  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 
554 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  37.14 
 
 
535 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.19 
 
 
566 aa  172  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 
423 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 
555 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.52 
 
 
566 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 
555 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.78 
 
 
555 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  34.08 
 
 
623 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
563 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
563 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 
563 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>