More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2378 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 524 aa  1054    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  74.28 
 
 		 524 aa  758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  58.66 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  56.62 
 
 		 527 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  58.94 
 
 		 527 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  55.36 
 
 		 524 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  51.69 
 
 		 537 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  56.94 
 
 		 524 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  54.06 
 
 		 537 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  51.22 
 
 		 533 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  45.86 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  43.42 
 
 		 531 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  45.97 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  40.38 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 		 533 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  36.11 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 550 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.64 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 537 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 535 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.52 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 526 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  34.15 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  31.94 
 
 		 550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 624 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 		 531 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.36 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 		 553 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  35.66 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 538 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 		 527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.75 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 		 526 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 525 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  31.09 
 
 		 581 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 		 555 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.64 
 
 		 621 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 555 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 		 555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 633 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  33.64 
 
 		 531 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 488 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  29.07 
 
 		 566 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 566 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  33.15 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  31.66 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 548 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.42 
 
 		 698 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  29.28 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 511 aa  203  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 527 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 		 631 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.18 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 		 527 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 545 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  29.01 
 
 		 654 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  30.93 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.84 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  27.72 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 542 aa  193  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 549 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  29.18 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.25 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>