More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2630 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
423 aa  825    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  69.83 
 
 
425 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  45.19 
 
 
533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  37.65 
 
 
531 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  38.68 
 
 
533 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  40 
 
 
524 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  39.45 
 
 
534 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 
524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  36.6 
 
 
527 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  37.5 
 
 
537 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  35.96 
 
 
525 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  38.1 
 
 
527 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  38.25 
 
 
533 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  37.13 
 
 
537 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  35.39 
 
 
524 aa  243  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  35.7 
 
 
531 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  36.75 
 
 
532 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 
532 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 
526 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
526 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
526 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
526 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
526 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
526 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.49 
 
 
536 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.21 
 
 
526 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  35.22 
 
 
553 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 
528 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.13 
 
 
535 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 
537 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  36.05 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 
539 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
534 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  36.78 
 
 
537 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  35.25 
 
 
550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 
527 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  34.45 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 
526 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.39 
 
 
527 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  34.2 
 
 
535 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  34.84 
 
 
531 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  33.67 
 
 
624 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  36.01 
 
 
624 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  34.78 
 
 
550 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  34.75 
 
 
538 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 
556 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
524 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.09 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.37 
 
 
566 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 
548 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 
548 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.69 
 
 
526 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 
548 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 
523 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
564 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.08 
 
 
527 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 
548 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 
527 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 
563 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 
555 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 
563 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.1 
 
 
526 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  31.95 
 
 
530 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.51 
 
 
551 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 
563 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 
563 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 
829 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.68 
 
 
624 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 
527 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  32.16 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
521 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  33.73 
 
 
621 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
555 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
555 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 
527 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 
527 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 
527 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.29 
 
 
555 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.95 
 
 
551 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
633 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 
525 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.59 
 
 
571 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 
555 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
548 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  30.5 
 
 
654 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
549 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 
533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  33.88 
 
 
581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  34.94 
 
 
523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  31.85 
 
 
548 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 
525 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
525 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
526 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
549 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
549 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.06 
 
 
553 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>