More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0305 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 560 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 560 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 564 aa  1103    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 560 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  66.19 
 
 		 562 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  65.48 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  47.56 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  43.32 
 
 		 495 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  39.21 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  39.21 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  39.1 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.4 
 
 		 537 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  39.16 
 
 		 488 aa  262  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  35.83 
 
 		 566 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.94 
 
 		 536 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 534 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  33.45 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  38.69 
 
 		 624 aa  234  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.32 
 
 		 571 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.7 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  33.45 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.28 
 
 		 537 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.24 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 621 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.73 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.1 
 
 		 550 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 		 535 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 829 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  35.16 
 
 		 623 aa  213  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  34.88 
 
 		 624 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.33 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.8 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.65 
 
 		 527 aa  199  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 423 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  33.69 
 
 		 535 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  32.35 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 526 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 		 535 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 		 535 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 		 553 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 		 537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 		 526 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.75 
 
 		 524 aa  181  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  42.12 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 527 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 538 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.57 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.74 
 
 		 527 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.27 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.27 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  25.89 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  25.89 
 
 		 532 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 		 523 aa  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.38 
 
 		 528 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.24 
 
 		 581 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 		 553 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  27.85 
 
 		 548 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  28.42 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  26.33 
 
 		 563 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>