More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4047 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 488 aa  953    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  54.69 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  54.49 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  54.49 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  48.68 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  39.39 
 
 		 531 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  40.12 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 534 aa  280  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  47.96 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 		 564 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  37.37 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  42.13 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  42.68 
 
 		 621 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 		 624 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  41.51 
 
 		 624 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  42.74 
 
 		 624 aa  263  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  35.01 
 
 		 533 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  32.58 
 
 		 533 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 		 537 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 537 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  36.65 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  41.38 
 
 		 626 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 537 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 568 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  36.06 
 
 		 550 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  34.34 
 
 		 524 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 		 623 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  36.88 
 
 		 550 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  42.69 
 
 		 556 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  36.69 
 
 		 539 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  31.73 
 
 		 527 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  31.55 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  36.4 
 
 		 538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  36.48 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  36.96 
 
 		 524 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 524 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  36.27 
 
 		 526 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  36.27 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  36.94 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  38.66 
 
 		 552 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.12 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  38.48 
 
 		 527 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.83 
 
 		 531 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.39 
 
 		 425 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.19 
 
 		 526 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  37.09 
 
 		 526 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  35.98 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  35.08 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.85 
 
 		 524 aa  199  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.35 
 
 		 532 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  34.45 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.35 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  31.94 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  36.77 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 526 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 526 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 548 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  31.75 
 
 		 555 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  31.8 
 
 		 524 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.99 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  35.7 
 
 		 535 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.79 
 
 		 527 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.06 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 555 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 633 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 555 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 555 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  28.71 
 
 		 548 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.47 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 		 525 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  36.6 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  36.6 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.77 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>