More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0315 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  86.96 
 
 		 539 aa  804    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  78.95 
 
 		 533 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 550 aa  1075    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  62.62 
 
 		 535 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  74.06 
 
 		 535 aa  765    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  80.7 
 
 		 550 aa  798    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  37.85 
 
 		 531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  43.4 
 
 		 553 aa  342  8e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  39.2 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  33.91 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  37.95 
 
 		 528 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  38.71 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 526 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 537 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  40 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  38.52 
 
 		 526 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  34.83 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 		 531 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  38.1 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  32.72 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 524 aa  272  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  38.9 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.71 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  34.32 
 
 		 527 aa  270  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 		 527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.81 
 
 		 537 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  36.04 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  37.31 
 
 		 527 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  37.31 
 
 		 527 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  37.31 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  36.95 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.28 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 536 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 		 527 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  35.78 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.91 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.91 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.91 
 
 		 533 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  36.1 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  38.11 
 
 		 530 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 		 425 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  36.43 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 526 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.35 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.43 
 
 		 624 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.83 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.83 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  34.88 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  34.88 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  34.33 
 
 		 549 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 623 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  35.24 
 
 		 526 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 551 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 		 526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  34.99 
 
 		 526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  34.89 
 
 		 526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  34.89 
 
 		 526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 		 423 aa  213  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  38.46 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.14 
 
 		 621 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.49 
 
 		 624 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.07 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  35.33 
 
 		 545 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.03 
 
 		 551 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 563 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 563 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 563 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  32.41 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 829 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 535 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 		 549 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  36.96 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.4 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.47 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.08 
 
 		 654 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>