295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4293 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  71.56 
 
 
585 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  68.84 
 
 
555 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  68.84 
 
 
555 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  71.92 
 
 
654 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 
551 aa  1076    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  91.47 
 
 
551 aa  991    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  69.2 
 
 
633 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  68.84 
 
 
631 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  69.02 
 
 
555 aa  720    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  68.84 
 
 
555 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  79.13 
 
 
554 aa  826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  69.2 
 
 
555 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  71.56 
 
 
555 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  71.56 
 
 
555 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  50.81 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  49.36 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  49.55 
 
 
548 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  49.73 
 
 
563 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  49.55 
 
 
563 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  49.18 
 
 
548 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  49.55 
 
 
563 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  49.73 
 
 
563 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  49.09 
 
 
548 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  47.83 
 
 
548 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  48.92 
 
 
549 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  50.09 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  49.37 
 
 
549 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  49.37 
 
 
549 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  49.37 
 
 
549 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  45.65 
 
 
552 aa  430  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  48.03 
 
 
581 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  47.85 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  44.92 
 
 
577 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  45.13 
 
 
566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  48.47 
 
 
548 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  45.13 
 
 
566 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  49.46 
 
 
543 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  49.01 
 
 
566 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  49.09 
 
 
548 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  46.17 
 
 
545 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  44.81 
 
 
546 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  44.94 
 
 
549 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.35 
 
 
577 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  45.23 
 
 
542 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  49.46 
 
 
548 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  44.08 
 
 
547 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  45.2 
 
 
545 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  42.83 
 
 
546 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 
560 aa  343  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  49.37 
 
 
545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  34.38 
 
 
533 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.07 
 
 
705 aa  247  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  35.12 
 
 
666 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.06 
 
 
698 aa  237  5.0000000000000005e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  38.25 
 
 
666 aa  236  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.03 
 
 
531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
692 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
692 aa  233  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
680 aa  232  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
680 aa  232  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  32.14 
 
 
679 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  35.05 
 
 
690 aa  227  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  31.24 
 
 
533 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  35.22 
 
 
757 aa  226  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 
534 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  38.08 
 
 
770 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
526 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  35.69 
 
 
526 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 
528 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 
524 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 
532 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 
553 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.55 
 
 
532 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.21 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 
550 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  30.83 
 
 
537 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 
527 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  33.01 
 
 
689 aa  196  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  35.36 
 
 
526 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 
653 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 
525 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.94 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>