More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0325 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 537 aa  1072    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  63.48 
 
 		 533 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  54.89 
 
 		 537 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  53.64 
 
 		 534 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  51.69 
 
 		 524 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  49.43 
 
 		 531 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  53.36 
 
 		 537 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  50.38 
 
 		 524 aa  498  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  49.45 
 
 		 525 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  49.9 
 
 		 524 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  48.84 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  44.87 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  46.27 
 
 		 527 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  40.62 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  39.11 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 535 aa  280  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.91 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.91 
 
 		 537 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  35.46 
 
 		 553 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  34.78 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 550 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  37.89 
 
 		 425 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 		 532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 		 532 aa  250  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.35 
 
 		 535 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 538 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.83 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 531 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.37 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 528 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  33.86 
 
 		 624 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.07 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 624 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  37.29 
 
 		 526 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  35.64 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 526 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 		 423 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 526 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 526 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 488 aa  217  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  36.27 
 
 		 527 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  32.71 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 525 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 525 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.39 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  30.87 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  32.13 
 
 		 526 aa  210  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  29.15 
 
 		 581 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  30.68 
 
 		 566 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 566 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 		 621 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.38 
 
 		 527 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 		 624 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 545 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.19 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  29.12 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 		 535 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  31.22 
 
 		 549 aa  203  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 548 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.83 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 		 523 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 623 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 626 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>