More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0492 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  75.98 
 
 		 539 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 533 aa  1046    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  78.95 
 
 		 550 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  65.94 
 
 		 535 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  76.74 
 
 		 550 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  73.5 
 
 		 535 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 531 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  37.17 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  35.57 
 
 		 533 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  41.17 
 
 		 553 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  37.86 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  40.54 
 
 		 531 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  37.22 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  37.88 
 
 		 526 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 534 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  37.69 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  36.95 
 
 		 527 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  35.4 
 
 		 537 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  36.01 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  35.9 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.65 
 
 		 525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.73 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 		 538 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 527 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 		 524 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.3 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  35.23 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  32.47 
 
 		 527 aa  246  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  36.43 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.51 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.14 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.14 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.94 
 
 		 533 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 		 526 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  34.72 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  37.8 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 524 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.76 
 
 		 624 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 532 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.2 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  34.2 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  33.89 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.53 
 
 		 624 aa  220  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.93 
 
 		 621 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 526 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  39.02 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  39.22 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  39.22 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 524 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 		 564 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 623 aa  206  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 549 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  32.56 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.58 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 		 527 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.6 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 		 829 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 521 aa  190  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 		 535 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  33.19 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.81 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  32.51 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.7 
 
 		 566 aa  183  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 555 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.73 
 
 		 555 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  31 
 
 		 566 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.73 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>