More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3597 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  75.44 
 
 
568 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
560 aa  1103    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
560 aa  1103    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 
564 aa  714    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
560 aa  1103    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  77.01 
 
 
562 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  46.06 
 
 
556 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  45.55 
 
 
495 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  40.21 
 
 
533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  40.04 
 
 
533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  40.04 
 
 
533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.66 
 
 
536 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  37.08 
 
 
537 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 
488 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.72 
 
 
531 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30 
 
 
537 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.63 
 
 
624 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  34.01 
 
 
535 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.92 
 
 
571 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.89 
 
 
566 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  30.44 
 
 
534 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.06 
 
 
537 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 
624 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.6 
 
 
552 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  34.16 
 
 
621 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  36.22 
 
 
623 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  33.05 
 
 
581 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.57 
 
 
535 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 
829 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 
533 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.41 
 
 
624 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 
524 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  28.81 
 
 
533 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 
524 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
533 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 
550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
423 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 
550 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.2 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  34.29 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
425 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
531 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 
539 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.14 
 
 
534 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 
528 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 
533 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.63 
 
 
527 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  35.46 
 
 
527 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.61 
 
 
553 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 
527 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.22 
 
 
526 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 
527 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 
527 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  35.64 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  30.94 
 
 
524 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  35.05 
 
 
527 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
532 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  30.69 
 
 
526 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
532 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.38 
 
 
526 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 
527 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.1 
 
 
530 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 
523 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 
526 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 
626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 
525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.6 
 
 
527 aa  174  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  42.47 
 
 
601 aa  174  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  30.63 
 
 
526 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.96 
 
 
528 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
525 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.8 
 
 
526 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 
526 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
521 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  33.58 
 
 
535 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 
524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 
545 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
525 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
563 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 
531 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
548 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>