More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0903 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  92.38 
 
 		 525 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 525 aa  1002    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  99.62 
 
 		 525 aa  999    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  67.24 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  65.53 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  64.89 
 
 		 521 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  47.77 
 
 		 556 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  43.07 
 
 		 519 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  41.32 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3364  sodium/hydrogen exchanger  41.52 
 
 		 514 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.245657  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3170  Sodium/hydrogen exchanger  47.31 
 
 		 542 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3361  sodium/hydrogen exchanger  46.95 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3287  sodium/hydrogen exchanger  48.27 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  36.53 
 
 		 538 aa  266  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  38.61 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.68 
 
 		 531 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.61 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.99 
 
 		 531 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  34.93 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 526 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 531 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 		 528 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.67 
 
 		 534 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.08 
 
 		 526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  37.23 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  35.28 
 
 		 527 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  32.57 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 531 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  35.55 
 
 		 527 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  37.07 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 		 537 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  36.62 
 
 		 527 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  32.27 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.56 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  36.79 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  34.07 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 532 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  35.16 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 425 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.94 
 
 		 527 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 535 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 		 526 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 		 526 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 		 524 aa  204  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  35.83 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  34.28 
 
 		 537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.95 
 
 		 624 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 		 527 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.09 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  30.94 
 
 		 536 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.03 
 
 		 550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.66 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  38.19 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  38.19 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  38.19 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.07 
 
 		 539 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  36.83 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  32.4 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.59 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.38 
 
 		 624 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 		 626 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 623 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.47 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  37.04 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  37.04 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 		 548 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  30.87 
 
 		 571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 488 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.3 
 
 		 581 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 523 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.05 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.28 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>