More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3364 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3364  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 514 aa  1000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.245657  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  93.97 
 
 		 514 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  50.78 
 
 		 519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  45.11 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  43.84 
 
 		 521 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  42.38 
 
 		 511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  43.15 
 
 		 525 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  42.69 
 
 		 525 aa  309  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  42.48 
 
 		 525 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 		 521 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  41.11 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  37.58 
 
 		 534 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 538 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3170  Sodium/hydrogen exchanger  44.2 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3361  sodium/hydrogen exchanger  43.82 
 
 		 543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3287  sodium/hydrogen exchanger  43.89 
 
 		 542 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.16 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.93 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  34.35 
 
 		 524 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  34.01 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.96 
 
 		 534 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  32.96 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.97 
 
 		 526 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  36.19 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.17 
 
 		 524 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.29 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.72 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 536 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  34.54 
 
 		 527 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  34.54 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.87 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.59 
 
 		 527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  32.42 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.09 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 		 526 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  27.91 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.84 
 
 		 624 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  34.68 
 
 		 527 aa  179  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.12 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.87 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 624 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.94 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  31.39 
 
 		 623 aa  173  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.47 
 
 		 524 aa  173  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 		 624 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  29.94 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.09 
 
 		 571 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  32.11 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 626 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  32.11 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  32.11 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  31.3 
 
 		 527 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 523 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  29.1 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.21 
 
 		 621 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 510 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  35.12 
 
 		 523 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  27.75 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 		 535 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  27.55 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>