More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0379 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
531 aa  1031    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  69.58 
 
 
526 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  66.6 
 
 
527 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  68.13 
 
 
527 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  68.51 
 
 
527 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  69.58 
 
 
528 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  69.77 
 
 
526 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  67.94 
 
 
527 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  67.56 
 
 
527 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  67.56 
 
 
527 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  67.56 
 
 
527 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  54.1 
 
 
526 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  53.92 
 
 
526 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  48.48 
 
 
538 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  50.6 
 
 
534 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  49.05 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  48.71 
 
 
524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  42.28 
 
 
528 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  42.18 
 
 
526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  40.41 
 
 
526 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  42.37 
 
 
526 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  41.51 
 
 
526 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  42.56 
 
 
526 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 
526 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 
531 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  38.49 
 
 
535 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  39.61 
 
 
531 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  43.94 
 
 
553 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  37.07 
 
 
535 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 
550 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
533 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  35.08 
 
 
534 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 
533 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  37.86 
 
 
533 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  38.04 
 
 
539 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  37.66 
 
 
550 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
537 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  40.46 
 
 
537 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  32.83 
 
 
537 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 
425 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 
521 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 
524 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 
524 aa  240  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
537 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.5 
 
 
525 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 
525 aa  233  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 
525 aa  233  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  35.57 
 
 
624 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 
525 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 
533 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 
527 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 
521 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.36 
 
 
511 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 
524 aa  224  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 
524 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 
532 aa  223  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 
532 aa  223  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  31.11 
 
 
527 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 
621 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 
624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.8 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 
624 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.73 
 
 
553 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 
551 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
423 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 
513 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  33.9 
 
 
566 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  34.26 
 
 
545 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
536 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 
566 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  33.07 
 
 
581 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  37.68 
 
 
623 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 
549 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.69 
 
 
551 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  34.4 
 
 
546 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  35.12 
 
 
519 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.82 
 
 
555 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 
555 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.3 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 
527 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 
555 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 
555 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.34 
 
 
571 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 
633 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  34.32 
 
 
542 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  38.73 
 
 
626 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.47 
 
 
566 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  35.14 
 
 
535 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
514 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>