More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3839 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  100 
 
 		 527 aa  1050    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  78.18 
 
 		 527 aa  840    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  58.94 
 
 		 524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  57.93 
 
 		 524 aa  558  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  53.18 
 
 		 525 aa  528  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  53.12 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  47.23 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  46.27 
 
 		 537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  47.88 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  47.4 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  43.79 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  42.23 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  40.29 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  43.75 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  38.81 
 
 		 533 aa  297  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  36.61 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  34.32 
 
 		 550 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 535 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  35.07 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 534 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  35.69 
 
 		 550 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 526 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.33 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.21 
 
 		 526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.64 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  38.61 
 
 		 423 aa  227  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 		 531 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.75 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 		 536 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.11 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 633 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.58 
 
 		 555 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 		 526 aa  207  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.14 
 
 		 526 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.76 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.88 
 
 		 581 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  29.7 
 
 		 654 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 624 aa  200  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  31.56 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.58 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.44 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 521 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  29.1 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  27.65 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.79 
 
 		 698 aa  193  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.1 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.45 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  28.08 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 585 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 513 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.18 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  29.71 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  29.34 
 
 		 631 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  30.92 
 
 		 523 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  27.9 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  29.16 
 
 		 624 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  28.79 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  30.66 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  27.55 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  31.39 
 
 		 526 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  28.87 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>