More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0519 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 539 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  76.13 
 
 		 533 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  86.96 
 
 		 550 aa  879    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  63.44 
 
 		 535 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  72.13 
 
 		 535 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  80.23 
 
 		 550 aa  770    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  38.29 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  39.77 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  43.64 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  36.79 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  35.95 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  39.55 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  39.37 
 
 		 526 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  39.18 
 
 		 526 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  39.66 
 
 		 526 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  39.33 
 
 		 527 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  38.45 
 
 		 531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  40.88 
 
 		 531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  34.6 
 
 		 524 aa  277  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  35.92 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  34.29 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  34.89 
 
 		 527 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  35.16 
 
 		 524 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 527 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  34.16 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 533 aa  270  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  38.52 
 
 		 527 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  38.51 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  37.89 
 
 		 527 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  38.34 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  37.52 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  38.03 
 
 		 527 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  36.05 
 
 		 536 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  37.99 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  37.99 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  36.14 
 
 		 526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.57 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  36.07 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  36.47 
 
 		 524 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  36.52 
 
 		 526 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  38.54 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  38.54 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  33.6 
 
 		 524 aa  240  5e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 		 425 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  38.54 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.35 
 
 		 528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 		 526 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.88 
 
 		 624 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  37.07 
 
 		 488 aa  230  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  41.29 
 
 		 530 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  37.52 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.63 
 
 		 624 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  37.64 
 
 		 526 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  34.82 
 
 		 623 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 		 423 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  37.45 
 
 		 526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  37.45 
 
 		 526 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  37.71 
 
 		 526 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  36.59 
 
 		 621 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  35.29 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  39.35 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  34.12 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 		 551 aa  210  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  33.76 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  33.55 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.42 
 
 		 552 aa  203  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.16 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 535 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.62 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 521 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.82 
 
 		 624 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.81 
 
 		 566 aa  193  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  34.33 
 
 		 545 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  30.44 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  30.44 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.44 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  31.23 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 548 aa  190  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  33 
 
 		 555 aa  190  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 		 829 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>