More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3769 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
527 aa  1017    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  37.82 
 
 
537 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  37.55 
 
 
553 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.13 
 
 
533 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 
531 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 
534 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.49 
 
 
531 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.56 
 
 
536 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 
550 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
425 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 
423 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 
533 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 
533 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
526 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 
537 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.38 
 
 
524 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 
524 aa  201  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.51 
 
 
535 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 
535 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.26 
 
 
528 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 
527 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.44 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.72 
 
 
527 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  35.48 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 
528 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 
564 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 
524 aa  193  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.08 
 
 
534 aa  193  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
527 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
526 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
527 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
527 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.51 
 
 
624 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 
526 aa  190  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.43 
 
 
537 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  26.41 
 
 
524 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.38 
 
 
624 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 
524 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.01 
 
 
566 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 
539 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.13 
 
 
538 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 
533 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 
533 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  33.07 
 
 
624 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.77 
 
 
526 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 
526 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
552 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 
533 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 
537 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
526 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 
526 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  31.75 
 
 
531 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  27.08 
 
 
532 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.08 
 
 
532 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 
526 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 
556 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  25.67 
 
 
527 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.93 
 
 
553 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.86 
 
 
581 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 
525 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
511 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 
548 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  27.61 
 
 
548 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
548 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 
563 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
692 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
692 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 
549 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 
531 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  28.88 
 
 
548 aa  160  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 
549 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 
549 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 
549 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
525 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
525 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 
829 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  28.17 
 
 
552 aa  158  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.33 
 
 
555 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 
548 aa  157  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>