More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6240 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 537 aa  1075    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  54.89 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  56.82 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  53.85 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  52.83 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  49.52 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  45.3 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  50 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  47.16 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  45.35 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  48.74 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  47.64 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  47.55 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  41.28 
 
 		 533 aa  364  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  37.52 
 
 		 533 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.69 
 
 		 534 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 		 550 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 550 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.41 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.56 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 		 425 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.76 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 532 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 		 532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.1 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.44 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.63 
 
 		 553 aa  239  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 526 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 551 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 		 526 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 526 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.68 
 
 		 524 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.72 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  31.78 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 624 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  31.78 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  31.45 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 538 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  31.4 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  32.75 
 
 		 624 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.47 
 
 		 551 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.95 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  29.86 
 
 		 633 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 		 527 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 526 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 488 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 		 527 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  30.12 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.74 
 
 		 581 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  30.12 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 		 545 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  28.68 
 
 		 555 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  32.42 
 
 		 624 aa  210  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  28.63 
 
 		 555 aa  210  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.33 
 
 		 553 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  30.67 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  27.24 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 564 aa  203  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.37 
 
 		 527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 631 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 525 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 525 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  28.82 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 521 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  27.41 
 
 		 654 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.2 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  31.3 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.44 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>