More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6974 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  73.26 
 
 		 526 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  69.58 
 
 		 531 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 528 aa  1036    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  73.26 
 
 		 526 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  70.45 
 
 		 527 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  73.67 
 
 		 526 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  73.26 
 
 		 526 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  73.07 
 
 		 526 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  71.64 
 
 		 527 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  71.59 
 
 		 527 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  71.64 
 
 		 527 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  72.73 
 
 		 527 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  71.59 
 
 		 527 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  71.59 
 
 		 527 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  73.26 
 
 		 526 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  73.26 
 
 		 526 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  72.88 
 
 		 526 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  54.92 
 
 		 526 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  54.79 
 
 		 526 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  52.11 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  52.33 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  50.67 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  46.81 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  43.16 
 
 		 526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  42.18 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  42.88 
 
 		 526 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  43.16 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.25 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  43.15 
 
 		 526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  42.11 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  37.72 
 
 		 535 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  37.83 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 		 531 aa  283  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  36.64 
 
 		 535 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  37.03 
 
 		 550 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  39.51 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 		 531 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 		 537 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  31.45 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 		 525 aa  249  7e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  37.94 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  34.28 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  39.5 
 
 		 539 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  38.17 
 
 		 537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 		 537 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 524 aa  233  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 521 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 		 525 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 		 525 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.99 
 
 		 511 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  35.9 
 
 		 524 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.26 
 
 		 624 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.09 
 
 		 624 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.22 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.82 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.9 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.67 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  32.8 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.67 
 
 		 555 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.58 
 
 		 533 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.04 
 
 		 552 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.16 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 423 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  36.18 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  36.18 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  32.39 
 
 		 581 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.06 
 
 		 546 aa  199  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 		 624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.68 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 		 621 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 549 aa  193  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.35 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  35.77 
 
 		 623 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.11 
 
 		 654 aa  190  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  31.93 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 631 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  34.74 
 
 		 770 aa  187  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.07 
 
 		 566 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  32.73 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  37.77 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30.32 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 513 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>