More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3978 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 537 aa  1081    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  54.03 
 
 		 531 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  56.29 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  53.36 
 
 		 537 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  55.1 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  47.79 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  45.97 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  44.42 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  44.74 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  43.16 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  43.58 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  43.45 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  42.26 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  40.6 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.61 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.72 
 
 		 553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 550 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 		 550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  36.72 
 
 		 538 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 		 537 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.65 
 
 		 535 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  34.44 
 
 		 531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.06 
 
 		 624 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  35.76 
 
 		 539 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.12 
 
 		 528 aa  269  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  35.87 
 
 		 624 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 		 526 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 		 528 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.9 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 533 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.91 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 536 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.33 
 
 		 621 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 526 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 526 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 531 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  35.01 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  33.09 
 
 		 566 aa  240  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 566 aa  236  9e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.81 
 
 		 524 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  35.07 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  34.1 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.5 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.72 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 551 aa  230  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 555 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 525 aa  229  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 555 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  36.91 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.77 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 525 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  30.47 
 
 		 654 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.64 
 
 		 527 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 511 aa  223  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.96 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  31.77 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  31.29 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 631 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 		 563 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 		 563 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>