More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0511 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
624 aa  1229    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  53.98 
 
 
621 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  48.45 
 
 
624 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  49.51 
 
 
624 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  47.85 
 
 
623 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  48.51 
 
 
626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  43.02 
 
 
537 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
829 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  41.73 
 
 
552 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 
533 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 
533 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 
533 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  38.39 
 
 
536 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  39.3 
 
 
566 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  33.09 
 
 
533 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
524 aa  263  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  36.36 
 
 
571 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  38.79 
 
 
553 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 
533 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.23 
 
 
531 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 
537 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  42.48 
 
 
527 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 
526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  42.74 
 
 
488 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  35.51 
 
 
526 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  37.89 
 
 
527 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
524 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  34.65 
 
 
533 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 
564 aa  238  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
537 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
535 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  36.55 
 
 
527 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 
538 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 
532 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 
425 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  35.62 
 
 
531 aa  227  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 
532 aa  227  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 
526 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 
537 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  36.17 
 
 
527 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  36.17 
 
 
527 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  36.23 
 
 
550 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.4 
 
 
527 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.93 
 
 
528 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.95 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  35.98 
 
 
527 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  35.98 
 
 
527 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 
527 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  42.07 
 
 
556 aa  219  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 
527 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  45.9 
 
 
581 aa  217  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
524 aa  213  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  34.4 
 
 
524 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.78 
 
 
531 aa  212  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  34.01 
 
 
550 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.9 
 
 
524 aa  210  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.86 
 
 
528 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.58 
 
 
551 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 
526 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
423 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 
526 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  38.91 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
513 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 
526 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  36.69 
 
 
535 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  46.39 
 
 
601 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 
526 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.67 
 
 
551 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 
533 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  34.07 
 
 
527 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 
526 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  34.81 
 
 
526 aa  194  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
525 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 
521 aa  193  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 
511 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.84 
 
 
539 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 
535 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 
535 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  36.58 
 
 
530 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 
555 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  32.04 
 
 
566 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 
566 aa  187  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
633 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.75 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
555 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>