More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  100 
 
 		 571 aa  1120    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  48.11 
 
 		 829 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  48.06 
 
 		 566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  45.19 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  44.54 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  36.25 
 
 		 624 aa  296  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  37.32 
 
 		 624 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 621 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  36.69 
 
 		 623 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 		 626 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  36.35 
 
 		 624 aa  267  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.15 
 
 		 531 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.78 
 
 		 536 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.28 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 564 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.71 
 
 		 525 aa  230  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.87 
 
 		 553 aa  220  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 533 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  34.1 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  34.1 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 568 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.24 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  48.11 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.2 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.08 
 
 		 535 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  30.24 
 
 		 550 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.9 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 		 528 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 521 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  34.39 
 
 		 562 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 		 531 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 524 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 526 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 527 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.35 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  28.75 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.22 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.18 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 		 535 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  32.86 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  29.24 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  31.17 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 524 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 526 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 		 527 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  36.99 
 
 		 537 aa  186  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  33.87 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  33.87 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 		 527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 		 511 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.33 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 		 524 aa  181  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  26.88 
 
 		 527 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.19 
 
 		 527 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.46 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  33.83 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.46 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  34.9 
 
 		 495 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  33.94 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  29 
 
 		 553 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  28.87 
 
 		 577 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  41.37 
 
 		 556 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  31.95 
 
 		 530 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  28.81 
 
 		 581 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 525 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  28.18 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.74 
 
 		 563 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>