More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4050 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  66.19 
 
 
564 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  77.01 
 
 
560 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  77.01 
 
 
560 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  88.79 
 
 
568 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  77.01 
 
 
560 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
562 aa  1088    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  46.3 
 
 
556 aa  330  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  44.49 
 
 
495 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  42.75 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  42.57 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  42.57 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  38.36 
 
 
537 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 
536 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  39.5 
 
 
488 aa  253  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  36.19 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.17 
 
 
531 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.28 
 
 
621 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 
534 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  35.15 
 
 
571 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 
624 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  38.98 
 
 
624 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.6 
 
 
525 aa  216  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 
535 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 
533 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.65 
 
 
624 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  36.25 
 
 
623 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.22 
 
 
552 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  35.79 
 
 
829 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
537 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.76 
 
 
524 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.04 
 
 
535 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 
550 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
581 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 
533 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 
537 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.57 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 
524 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 
533 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 
533 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  32.47 
 
 
539 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.74 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.42 
 
 
527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.64 
 
 
534 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
423 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  35.88 
 
 
535 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.22 
 
 
538 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 
526 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.26 
 
 
524 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 
526 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.01 
 
 
527 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 
527 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.28 
 
 
526 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.38 
 
 
524 aa  176  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
526 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  35.38 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.91 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 
537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 
526 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 
526 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.91 
 
 
531 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
524 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  34.61 
 
 
535 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  34.61 
 
 
535 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  33.09 
 
 
553 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 
526 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 
527 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  43.34 
 
 
601 aa  171  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  32.97 
 
 
527 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.97 
 
 
527 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 
527 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 
626 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 
527 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 
527 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 
527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  33.57 
 
 
523 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 
526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.53 
 
 
532 aa  164  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.53 
 
 
532 aa  163  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 
525 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.24 
 
 
528 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 
525 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.89 
 
 
525 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 
526 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 
531 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 
511 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  30.05 
 
 
535 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 
526 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  30.34 
 
 
523 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
692 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
692 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>