More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0521 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 550 aa  1080    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  80.23 
 
 		 539 aa  738    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  76.74 
 
 		 533 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  80.7 
 
 		 550 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  65.08 
 
 		 535 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  70.65 
 
 		 535 aa  732    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  38.04 
 
 		 531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  42.86 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 		 533 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  34.4 
 
 		 537 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  36.64 
 
 		 533 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 		 534 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 526 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  38.7 
 
 		 526 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  37.1 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 537 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  34.56 
 
 		 537 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  37.59 
 
 		 531 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  38.26 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  38.23 
 
 		 527 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  39.92 
 
 		 531 aa  274  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  35.95 
 
 		 525 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  34.06 
 
 		 524 aa  273  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  37.26 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  35.69 
 
 		 527 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  34.21 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  38.79 
 
 		 527 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  39.36 
 
 		 527 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.94 
 
 		 524 aa  264  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  39.36 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  39.36 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  38.68 
 
 		 527 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.94 
 
 		 524 aa  262  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  38 
 
 		 527 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.27 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.9 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  35.85 
 
 		 624 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  35.31 
 
 		 536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  35.04 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.1 
 
 		 531 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  35.24 
 
 		 524 aa  248  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  36.73 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  36.73 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 		 488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 624 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  36.08 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.15 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.69 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  35.69 
 
 		 524 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.73 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  36.01 
 
 		 621 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  31.6 
 
 		 532 aa  230  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.6 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  36.7 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  36.91 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  36.53 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  35.45 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  35.73 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  34.63 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.35 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  38.13 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  33.1 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.43 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.86 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  38.01 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 		 623 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  32.83 
 
 		 546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.11 
 
 		 654 aa  200  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  37.82 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  37.82 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.57 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  37 
 
 		 535 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 555 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  31.74 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 633 aa  197  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  31.08 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.81 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  31.76 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  30.8 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 		 829 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 545 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.36 
 
 		 566 aa  193  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>