More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0211 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 533 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  48.08 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  47.18 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  44.15 
 
 		 533 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  40.62 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  42.88 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  41.41 
 
 		 537 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  43.51 
 
 		 537 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  40.38 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  38.24 
 
 		 527 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  40.29 
 
 		 527 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  38.72 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  39.62 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  36.73 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  39.2 
 
 		 550 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  37.6 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  40.45 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  42.55 
 
 		 425 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  36.14 
 
 		 535 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  39.96 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  37.16 
 
 		 537 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  37.28 
 
 		 550 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  38.04 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.85 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  38.04 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  38.34 
 
 		 531 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  37.17 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 532 aa  266  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.08 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  37.82 
 
 		 526 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 532 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  38.24 
 
 		 526 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.38 
 
 		 551 aa  257  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  40.4 
 
 		 527 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  35.13 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 551 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  37.82 
 
 		 526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  37.82 
 
 		 526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.72 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 		 526 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 526 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  37.82 
 
 		 526 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  37.87 
 
 		 526 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 		 624 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.92 
 
 		 624 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.58 
 
 		 528 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.13 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 621 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 528 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  35.73 
 
 		 531 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.82 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  34.43 
 
 		 526 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 633 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 555 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 555 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 		 555 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.35 
 
 		 555 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  34.26 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  34.06 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  32.41 
 
 		 523 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  30.99 
 
 		 548 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 563 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 563 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.88 
 
 		 654 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.91 
 
 		 577 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  31.41 
 
 		 566 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  32.48 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 		 566 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 		 549 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 542 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  33.91 
 
 		 527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 527 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  36.38 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 527 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  33.07 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  33.07 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  33.78 
 
 		 624 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>