More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3166 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 542 aa  1058    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  71.16 
 
 		 546 aa  675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  75.38 
 
 		 545 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  64.77 
 
 		 546 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  64.34 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  57.06 
 
 		 545 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  54.74 
 
 		 549 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  51.74 
 
 		 566 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  51.56 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  45.74 
 
 		 551 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  45.65 
 
 		 551 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  43.4 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  45.13 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  43.12 
 
 		 548 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  44.96 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  44.95 
 
 		 633 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  45.31 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  45.31 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  45.13 
 
 		 555 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  45.49 
 
 		 555 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  43.3 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  45.81 
 
 		 654 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  44.85 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  43.25 
 
 		 548 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  41.23 
 
 		 548 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  43.12 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  43.12 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  43.12 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  41.62 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.86 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  44.42 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  44.01 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  43.65 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  40.71 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  40.87 
 
 		 548 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  44.96 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  44.96 
 
 		 555 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  44.96 
 
 		 555 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  43.53 
 
 		 543 aa  349  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  43.39 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  40.75 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  42.52 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 698 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.69 
 
 		 705 aa  259  8e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  33.15 
 
 		 533 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 667 aa  243  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 692 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 692 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  32.3 
 
 		 666 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 		 526 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 531 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 		 666 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  32.68 
 
 		 679 aa  227  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 690 aa  228  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 534 aa  226  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 680 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  39.08 
 
 		 770 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 680 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.38 
 
 		 534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.26 
 
 		 537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.93 
 
 		 524 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 757 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 		 526 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.58 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.99 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 525 aa  212  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.91 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 528 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 		 524 aa  210  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 		 532 aa  208  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 527 aa  207  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 		 535 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.83 
 
 		 688 aa  203  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>