287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2343 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
560 aa  1095    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  41.68 
 
 
551 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.21 
 
 
551 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  40.98 
 
 
563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  40.98 
 
 
563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  40.98 
 
 
563 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  43.34 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  41.2 
 
 
548 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  41.64 
 
 
555 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  40.98 
 
 
563 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  40.4 
 
 
548 aa  355  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  40.4 
 
 
548 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  42.17 
 
 
555 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  42.17 
 
 
555 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  42.17 
 
 
633 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  42.17 
 
 
555 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  42.35 
 
 
555 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  41.86 
 
 
553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  41.86 
 
 
581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  336  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  40.33 
 
 
549 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  40.51 
 
 
549 aa  334  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  41.11 
 
 
548 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  40.15 
 
 
548 aa  331  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  42.44 
 
 
654 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  42.65 
 
 
548 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  41.81 
 
 
631 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  42.5 
 
 
543 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  40.25 
 
 
549 aa  321  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  41.97 
 
 
585 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  41.97 
 
 
555 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  41.97 
 
 
555 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  43.17 
 
 
548 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  42.99 
 
 
566 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  38.88 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  38.88 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  38.88 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  38.85 
 
 
548 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  40.04 
 
 
577 aa  310  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  40.18 
 
 
546 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  41.7 
 
 
546 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  38.54 
 
 
549 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  37.46 
 
 
552 aa  298  1e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  39.06 
 
 
566 aa  294  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  38.88 
 
 
566 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  42.4 
 
 
548 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.7 
 
 
577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  40 
 
 
542 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  38.21 
 
 
545 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  38.42 
 
 
547 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  38.29 
 
 
545 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  42.67 
 
 
545 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  31.14 
 
 
698 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  34 
 
 
666 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.04 
 
 
705 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
680 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
680 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 
757 aa  207  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.28 
 
 
534 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 
533 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 
667 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  37.41 
 
 
770 aa  203  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 
531 aa  197  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
666 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.63 
 
 
537 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  26.62 
 
 
679 aa  193  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
425 aa  190  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 
680 aa  187  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 
537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.36 
 
 
532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.5 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.01 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
526 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
526 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 
528 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
526 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
526 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
526 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.36 
 
 
532 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
526 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
526 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 
524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  29.92 
 
 
689 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.71 
 
 
553 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.92 
 
 
525 aa  176  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  31.93 
 
 
690 aa  173  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 
533 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  28.43 
 
 
537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 
537 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.52 
 
 
524 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.12 
 
 
527 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>