More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0170 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
524 aa  1053    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  74.28 
 
 
524 aa  774    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  57.25 
 
 
527 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  56.25 
 
 
525 aa  570  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  57.93 
 
 
527 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  52.49 
 
 
524 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  55.75 
 
 
524 aa  519  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  49.62 
 
 
537 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  52.92 
 
 
537 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  48.68 
 
 
533 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  43.88 
 
 
534 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  43.05 
 
 
531 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  44.51 
 
 
537 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  38.78 
 
 
533 aa  359  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  36.26 
 
 
533 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  39.28 
 
 
425 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  34.78 
 
 
550 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  35.36 
 
 
534 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  34.08 
 
 
535 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
423 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 
550 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 
539 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.8 
 
 
535 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  33.72 
 
 
531 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 
537 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 
526 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  33.83 
 
 
526 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.09 
 
 
526 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.74 
 
 
526 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.37 
 
 
532 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.48 
 
 
536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 
532 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 
526 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 
553 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.65 
 
 
528 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 
538 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  35.87 
 
 
528 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.43 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
525 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
525 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
531 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  31.38 
 
 
533 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 
526 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  36.34 
 
 
526 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 
524 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.64 
 
 
624 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
525 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 
531 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
521 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
511 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
526 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 
548 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  34.8 
 
 
527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  34.8 
 
 
527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
555 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.8 
 
 
698 aa  200  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 
526 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 
526 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  31.54 
 
 
581 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 
577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  34.64 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 
549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 
526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 
553 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
564 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.44 
 
 
555 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  32.09 
 
 
526 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 
530 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
521 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 
526 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 
527 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  30.13 
 
 
547 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 
527 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 
488 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  34.41 
 
 
527 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.06 
 
 
566 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 
545 aa  194  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  27.59 
 
 
566 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  33.25 
 
 
631 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 
551 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.1 
 
 
551 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 
621 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  27.06 
 
 
554 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  28.2 
 
 
546 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 
545 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  31.36 
 
 
654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>