More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3138 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
547 aa  1070    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  65.32 
 
 
546 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  65.21 
 
 
542 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  65.44 
 
 
545 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  62.2 
 
 
546 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  58.61 
 
 
545 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  57.79 
 
 
549 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  53.75 
 
 
566 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  53.56 
 
 
566 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  45.27 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  44.36 
 
 
551 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  44.19 
 
 
555 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  45.27 
 
 
554 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  45.89 
 
 
631 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  44.36 
 
 
555 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  42.88 
 
 
555 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  42.88 
 
 
633 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  44.54 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  42.88 
 
 
555 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  45.4 
 
 
654 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 
563 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  41.17 
 
 
548 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 
563 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 
563 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 
563 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  43.48 
 
 
581 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  40.69 
 
 
548 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  41.27 
 
 
548 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  41.1 
 
 
548 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  43.45 
 
 
553 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  41.45 
 
 
548 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  40.73 
 
 
549 aa  359  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  43.69 
 
 
548 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  44.83 
 
 
585 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  40.76 
 
 
549 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  44.83 
 
 
555 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  44.83 
 
 
555 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  40.41 
 
 
577 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  40.29 
 
 
548 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  38.94 
 
 
552 aa  342  1e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  39.86 
 
 
549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  42.22 
 
 
577 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  39.86 
 
 
549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  39.86 
 
 
549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  43.19 
 
 
543 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 
566 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  43.24 
 
 
548 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  42.75 
 
 
548 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  38.22 
 
 
560 aa  293  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  44.83 
 
 
545 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
692 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
692 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.75 
 
 
698 aa  256  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  31.73 
 
 
705 aa  246  6e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  32.59 
 
 
666 aa  246  9e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  32.36 
 
 
533 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 
531 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  34.95 
 
 
679 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 
667 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
680 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
680 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
666 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.62 
 
 
690 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31.68 
 
 
534 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  37.97 
 
 
770 aa  228  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 
524 aa  226  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.03 
 
 
535 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 
524 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.14 
 
 
537 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 
533 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
757 aa  217  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 
524 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 
537 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  29.51 
 
 
525 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.23 
 
 
553 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 
532 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 
532 aa  206  9e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
526 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 
534 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 
526 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 
536 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.88 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.28 
 
 
688 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 
533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 
527 aa  200  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>