More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1739 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 536 aa  1054    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  45.84 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  42.64 
 
 		 533 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  42.64 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  42.64 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  45.67 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  40.42 
 
 		 624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  40.11 
 
 		 621 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 488 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  38.81 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  39.92 
 
 		 624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 		 537 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  34.08 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  38.97 
 
 		 623 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  38.95 
 
 		 624 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.75 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 560 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 560 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  34.24 
 
 		 560 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  39 
 
 		 552 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 564 aa  236  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 626 aa  230  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.64 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 550 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.55 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.86 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.85 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  40.95 
 
 		 556 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  38.26 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  35.31 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 528 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  35.57 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.95 
 
 		 535 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.12 
 
 		 571 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 		 537 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  33.39 
 
 		 568 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 581 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 		 563 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 		 563 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 524 aa  203  8e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  29.96 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.96 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.53 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 		 548 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.33 
 
 		 566 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 		 495 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 		 523 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 		 526 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  35.99 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 535 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4050  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 562 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553254  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  27.74 
 
 		 548 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 510 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 531 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  29.68 
 
 		 555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  29.68 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  29.68 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  27.74 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>