More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1649 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 524 aa  1050    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  58.82 
 
 		 525 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  55.36 
 
 		 524 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  57.34 
 
 		 524 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  52.49 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  50.38 
 
 		 537 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  47.98 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  47.23 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  46.18 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  47.45 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  43.02 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  41 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  43.35 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  36.73 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  33.77 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 425 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.93 
 
 		 534 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 		 550 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.64 
 
 		 526 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 		 526 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 		 526 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.32 
 
 		 535 aa  233  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.64 
 
 		 553 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.13 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 536 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 528 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 		 532 aa  213  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 531 aa  213  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  28.99 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  29.7 
 
 		 581 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 532 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.71 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.27 
 
 		 528 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  29.88 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  29.84 
 
 		 654 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  28.94 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  28.94 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.54 
 
 		 524 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 548 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 555 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 555 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 521 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  29.48 
 
 		 566 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 631 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.72 
 
 		 527 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 585 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 545 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 547 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 624 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 549 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12309  integral membrane transport protein yjcE  32.12 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 525 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  28.05 
 
 		 546 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 		 577 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 521 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 542 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 549 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 549 aa  183  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  29.08 
 
 		 549 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 549 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>