More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12309 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12309  integral membrane transport protein yjcE  100 
 
 		 542 aa  1054    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  44.81 
 
 		 530 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  42.18 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  32.2 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.92 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  34.39 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 534 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.5 
 
 		 537 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1944  Na+/H+ antiporter  38.32 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  34.65 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  29.71 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.48 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.76 
 
 		 535 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  28.79 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.04 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.43 
 
 		 537 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 533 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  33.15 
 
 		 550 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.37 
 
 		 539 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  35.11 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.38 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.57 
 
 		 524 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.38 
 
 		 532 aa  193  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.73 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 563 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 563 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 563 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 563 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 		 548 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.72 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  28.03 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.74 
 
 		 534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.16 
 
 		 524 aa  183  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.64 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  29.01 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  31.14 
 
 		 581 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  31.41 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  28.05 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 		 526 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  29.48 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.65 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  28.95 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.18 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 555 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 555 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  34.16 
 
 		 770 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  29.25 
 
 		 549 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 		 624 aa  170  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.81 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  28.97 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  30.53 
 
 		 654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  31.23 
 
 		 623 aa  165  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 692 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 692 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>