More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1944 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1944  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 539 aa  1017    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  43.79 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.73 
 
 		 531 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  40.13 
 
 		 531 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12309  integral membrane transport protein yjcE  39.43 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 535 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  36.2 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.03 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  34.77 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.96 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 524 aa  207  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  33.93 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.65 
 
 		 524 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.61 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  36.7 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.99 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  33.65 
 
 		 624 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.65 
 
 		 534 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.84 
 
 		 553 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.64 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  37.15 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  27.31 
 
 		 537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 		 526 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.22 
 
 		 621 aa  180  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 524 aa  180  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  33.9 
 
 		 624 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  32.94 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  27.8 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 		 527 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  31.6 
 
 		 531 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 524 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.09 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.09 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.09 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  35.43 
 
 		 535 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  30.78 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  27.34 
 
 		 527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  35.81 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.39 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.05 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.46 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 		 510 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 626 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  30.87 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  34.05 
 
 		 623 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  37.75 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.91 
 
 		 548 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.55 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.3 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.43 
 
 		 532 aa  150  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.43 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 		 525 aa  148  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  29.25 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  35.48 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30.46 
 
 		 554 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  27.32 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 525 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  26.99 
 
 		 548 aa  143  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 519 aa  143  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>